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viral_seq 1.10.0

A Ruby Gem with bioinformatics tools for processing viral NGS data. Specifically for Primer-ID sequencing and HIV drug resistance analysis.

Gemfile:
=

instalar:
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Versiones:

  1. 1.10.0 May 02, 2025 (3,6 MB)
  2. 1.9.1 December 02, 2024 (3,6 MB)
  3. 1.9.0 November 14, 2024 (3,6 MB)
  4. 1.8.1.1 June 04, 2024 (3,59 MB)
  5. 1.8.0 May 10, 2024 (3,59 MB)
Mostrar todas las versiones (52 total)

dependencias de Runtime (7):

colorize ~> 0.1
combine_pdf ~> 1.0, >= 1.0.0
muscle_bio = 0.4
prawn ~> 2.3, >= 2.3.0
prawn-table ~> 0.2, >= 0.2.0
shellwords ~> 0.2
virust-locator-ruby ~> 0.3

dependencias de Development (3):

bundler ~> 2.5
rake ~> 13.0
rspec ~> 3.0
Mostrar toda la cadena de dependencias

Requerimientos:

R required for some functions

Propietarios:

Subida por:

Autores:

  • Shuntai Zhou, Michael Clark

SHA 256 checksum:

=
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Total de descargas 61.930

Para esta versión 148

Versión publicada:

Licencia:

MIT

Versión de Ruby requerida: >= 2.5

Versión de Rubygems requerida: >= 1.3.6

Enlace:

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